N-COUNT取样,样本
Asampleof a substance is a small amount of it that is examined and analysed scientifically.

这个句子中

我先把句子翻译出来：

A sample of a substance is a small amount of it that is examined and analysed scientifically.
某种物质的样品是（经过科学检验和剖析的）少量物质。

从概念的对应来看，a small amount of 对应 A sample of；it 对应 a substance。在 A sample of a substance 中，of 确实含有“整体和部分的关系”，即：A sample是 a substance 的一部分。依据对应关系，既然主语是“整体和部分关系”，那样，表语也应该是这层关系。毕竟，a small amount 是名词，不是限定词。大家在理解时，总是把这个词组 a small amount of 整体看作限定词，这只不过权宜之计。其实，只用 of it 作定语，才反映了真的的修饰关系。意为：“某种物质的少许”。所以我赞同网友的怎么看。