鄂尔多斯生态环境职业学院有生态工程系、生物技术系、机电工程系、经济管理系、市政工程系、基础部、中职教育部等院系，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布的信息为准。

一、院系设置
生态工程系

生物技术系

机电工程系

经济管理系

市政工程系

基础部

中职教育部

二、鄂尔多斯生态环境职业学院简介
鄂尔多斯生态环境职业学院是内蒙古自治区人民政府批准成立、鄂尔多斯市政府投资建设、在鄂尔多斯市农牧学校基础上组建的一所高等职业院校，学院以培养生态建设、环境保护类应用型人才为重点设置专业，立足当地、面向西部、服务全区，将逐步打造成为以高职教育为主体、中职教育为辅助、成人函授和培训为补充的多元办学体系。

鄂尔多斯生态环境职业学院前身为1978年在达拉特旗成立的鄂尔多斯农牧学校，2011年更为为鄂尔多斯生态环境职业学院。