南阳医学高等专科学校有护理系、临床医学系、中医系、药学系、针灸骨伤系、医学技术系、卫生管理系、马克思主义学院、继续教育学院、国际教育学院等院系，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布的信息为准。

1、系部设置
护理系

临床医学系

中医系

药学系

针灸骨伤系

医学技术系

卫生管理系

马克思主义学院

继续教育学院

国际教育学院

康复医学系

口腔医学系

健康管理系

2、南阳医学高等专科学校简介
南阳医学高等专科学校（Nanyang Medical College），简称“南阳医专”，坐落于南阳市，是一所以西医为主体、中医为特色、中西合璧、优势互补的省属全日制医学类普通高等专科学校。学校为河南省博士后研发基地。

南阳医学高等专科学校前身是创办于1951年的南阳卫校，2004年经国家教育部批准升格为南阳医学高等专科学校。2006年南阳市委、市政府对南阳医学教育资源进行整合，将南阳中医药学校、南阳理工学院国医药系（原张仲景国医大学）并入南阳医学高等专科学校，形成了中西医结合、优势互补的办学格局。