安徽中医药高等专科学校有中医学系、药学系、康复保健系、护理系、口腔医学系、临床医学系、基础教学部、思政教研等院系，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布的信息为准。

1、院系设置
中医学系

药学系

康复保健系

护理系

口腔医学系

临床医学系

基础教学部

思政教研部

2、安徽中医药高等专科学校简介
安徽中医药高等专科学校（AnHui College of Traditional Chinese Medicine）位于安徽省芜湖市，是安徽省示范性高等职业院校。学校为教育部中医药职业教育教学指导委员会副主任委员单位、全国中医药职业技术教育学会常务副理事长单位、全国中医药高职高专教育教材建设指导委员会主任委员单位、安徽省中医药学会中医养生保健专业委员会理事长单位、安徽省药学会中药材种植（养殖）专业委员会理事长单位。

学校始建于1960年，时名“芜湖市中医学校”；1999年，经安徽省人民政府批准，学校更名为“安徽省中医药学校”，2001年，学校独立升格并于次年经教育部批准，在全国同类院校率先更名为“安徽中医药高等专科学校”，2010年，成功创建了“安徽省示范性高等职业院校”。