教育部直属高校有北京大学、清华大学、上海交通大学、复旦大学、浙江大学、中国人民大学、南京大学、西安交通大学、同济大学、武汉大学、南开大学、华中科技大学、北京师范大学、东南大学、四川大学等，以下是具体名单，供大家参考。